Rozsądnym wstępnym założeniem jest to, że podobne substancje mogą wykazywać podobne właściwości toksykologiczne. Obecność podobnych grup funkcyjnych powinna zostać wykryta w ramach naszej oceny podobieństwa. Dalsza analiza wpływu różnic strukturalnych na profil toksykologiczny odbywa się podczas ręcznej weryfikacji. Ogólnie rzecz biorąc, podczas weryfikacji stosuje się dość rygorystyczne kryteria podobieństwa strukturalnego.